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TCGA 数据库

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云馆首页 资源列表 TCGA 数据库 CHOL gdac.broadinstitute.org_CHOL.Mutation_Packager_Coverage.Level_3.2016012800.0.0
资源简介
本资源为 TCGA 泛癌种原始数据集合,按癌种缩写(ACC、BLCA、BRCA、COAD、GBM、LUAD、LUSC 等三十余种)分目录组织,收录 GDAC Broad Institute 于 2016 年 1 月发布的 Level 3 数据,涵盖 RNA-seq(基因/异构体/外显子/剪接接合定量)、miRNA-seq、DNA 甲基化、拷贝数变异与 SNP 芯片分段、体细胞突变 calls、RPPA 蛋白表达及临床信息等多种数据类型,同时附有各癌种汇总 CSV 文件、下载脚本及一份基于 enMCB 方法的分析工程(含差异表达、甲基化模块与生存预测流程)。适用于肿瘤多组学整合分析、分子分型、生物标志物筛选与生存建模等研究场景,可供生信分析人员在本地复现 TCGA 相关流程或开展泛癌比较研究。
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名称 大小 修改时间 操作
makelinks.sh 332 B 2017-11-25 04:32 登录
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TCGA-ZU-A8S4-01.wig.txt 138.9 MB 2017-11-25 03:34 登录
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